Tag: GeneChip

技術講習会(DNAマイクロアレイ解析装置)

DNAマイクロアレイ解析装置「Affimetrix社製:GeneChipシステム」に関する説明会の開催について お知らせします。 日時:2010年8月3日(火曜) 13時30分~15時00分 内容: ・GeneChipシステムの概要説明 ・各アプリケーションの紹介 ・使用例、論文例の紹介 ・質疑応答 場所:遺伝子実験施設(1F) セミナー室 担当:AffimetrixJapan株式会社 シニアフィールドアプリケーションスペシャリスト 渋谷健太 概要: GeneChipが世に出てから15年ほど経ちますが、その性能は飛躍的に向上しました。発売当初は1.28cm四方のガラス基板に1万種ほどのコンテンツ搭載が限度でしたが、現在では一枚に650万種類以上の配列の異なるオリゴヌクレオチドを固相化することが可能となりました。 集積度の向上により、DNAマイクロアレイは今や遺伝子の発現解析のみではなく、全トランスクリプトーム解析、SNP解析、エピジェネティクス解析、染色体コピー数解析といったものにまで応用範囲が広がっています。また、測定精度の大幅な向上によって、診断分野への取り組みも進んでおり、FDAがDNAマイクロアレイの性能評価を実施するプロジェクトチームを結成し、予防診断、オーダメイド医療への応用を模索しています。 現在、GeneChipを用いた査読付き論文の数は2万本を超えており、その多くは遺伝子発現解析ですが、最近は様々なアプリケーションに対応して幅広い研究分野に使用して頂いておりますが、本セミナーでは基礎研究分野で特に多く使用されている遺伝子発現解析アプリケーションを中心に実施例や論文紹介をすることによって、GeneChip技術の概要をお伝えし、ご研究にお役立て頂きたいと考えています。

技術講習会 マイクロアレイデータ解析ソフトウェア(GeneSpringGX)

遺伝子実験施設4階機器分析室に設置しておりますマイクロアレイ(GeneChip)について、マイクロアレイデータ解析ソフトウェア(GeneSpringGX)の講習会技術講習会を開催します。 日時:2008年9月25日(水) 13:30~14:00 GeneSpringGX ver.9によるマイクロアレイデータ解析 15:00~16:00 インジェヌイティーパスウェイアナリシスの概要 16:00~16:30 マイクロアレイデータを用いたネットワーク解析 場所:遺伝子実験施設 セミナー室 担当:小林隆明(トミーデジタルバイオロジー) 内容:マイクロアレイ解析システムの原理と応用 GeneSpringGXver.9は各社のエクスプレッションアレイデータを解析できるソフトウェアです。直感的な視覚ツールと、パワフルな統計解析ツールを備えた統合ソフトウェアであり、解析ワークフロー機能を搭載し、必要なデータ解析手法を容易に選択できます。初めてマイクロアレイデータを解析する方など幅広い方々にご利用いただけるツールです。 インジェヌイティーパスウェイアナリシス(IPA)は論文や公的データベース由来の相互作用情報などを独自に収集・データベース化し、膨大な情報を元に興味ある遺伝子群・タンパク質群のネットワーク解析や機能予測を行うことができ、今やネットワーク解析ツールのデファクトスタンダードとなっています。 補足:マイクロアレイデータ解析ソフトウェア(GeneSpringGX)はライセンス制となっております。