MALDI-TOFによるPMF解析の例 1

Posted on  August 10, 2012  in プロトコル, 質量分析装置

質量分析装置Autoflex Speedによるペプチド・マス・フィンガープリンティング(Peptide Mass Fingerprinting; PMF)の一例です。遺伝子実験施設の機材を使って実施してみました。参考になれば幸いです。

実験は概ね3日間かかります。
初日は電気泳動とゲル染色。二日目はゲルからのバンドの切り出しからゲル内酵素消化まで。三日目は酵素消化されたペプチドの脱塩・濃縮と質量分析というスケジュールです。
今回は二日目のバンド切り出しから紹介していきます。
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LC−MALDI解析サービスについて

Posted on  August 9, 2012  in お知らせ, 質量分析装置

遺伝子実験施設4階の機器分析室(406号室)に設置しています、質量測定装置(autoflex speed)のLC−MALDI解析サービスを開始します。

・申し込みは以下のリンク先のフォームから行って下さい。
・学生の場合、指導教員の了承を得てから 申し込むようにして下さい。
・予算管理者でない教員等 の場合、指導教員の欄に予算管理者の教員名を入力します。

　　LC−MALDI解析サービス 申込みフォーム

プロテアーゼでゲル内消化したペプチド混合物の分離・精製をナノフローHPLC EASY- nLCにより行い、専用フラクションコレクター PROTEINER fcで直接ターゲットプレートに分画をスポットしてMSあるいはMS/MS測定することができます。
二次元電気泳動でも多種類のタンパクが共存する場合などといった難しいサンプルの同定に有効です。
　
一定以上のピークが得られたスポットについてはMS/MS測定を実施します。
測定された結果からMascotサーチまで実施してお返しします。

【参考】消耗品代等

  • target　PAC384 Set for Priteomic II

    • 販売価格 20,000円　製品情報　

  • 試薬・チューブ等

    • 12,000円/384スポット分

通常1サンプル当り、180スポットの分画を測定します。従って384スポットで2サンプルまで対応できます。

利用に当たっての詳細は管理室までお問い合わせください。