技術講習会(DNAシークエンス)

DNAシークエンスに関する技術講習会を開催します(本年4月に実施された講習会とおなじ内容です)。
なお、希望者が多いと思われますので1回目、2回目に均等になるよう振り分けます。
今回のセミナーの受講を希望される方は下記のアドレスまで受講される方の名前(複数の場合はまとめて結構です)、所属、指導教員、希望の回を記入の上、施設までメールをお送り下さい。なお、資料の関係もありますので受付期限を13日(金曜)までとさせて頂きます。

  • 日時:2009年11月18日(水曜)
    1回目 午前10時00分~午後12時00分
    2回目 午後14時00分~午後16時00分
  • 内容:
    1. サンプルの精製についての説明(20分)
    2. シークエンス反応についての説明(20分)
    3. 反応後の過剰なDyeの除去方法説明(BigDyeX試薬)(20分)
    4. シークエンスデータ解析についてのトラブルシュート(20分)
    5. 質疑応答(10分)
    6. 新発売3500/3500XLジェネティックアナライザの紹介(30分)
  • 場所:遺伝子実験施設 セミナー室
  • 担当:近藤真人(アプライドバイオシステムズジャパン株式会社 アプリケーションサポート)
  • 概要
    クローニングされた遺伝子断片やPCR産物などのDNA断片を精製後サンガー法の酵素反応により4色の蛍光でラベルされた反応生成物が得られる。この反応生成物を3130DNAシークエンサーおよびシーケンス解析ソフトウェアで解析することによりDNAの塩基配列を決定する。
    以上の流れがDNAシークエンス解析の大まかな流れですが、質の良いデーターを取得する為に、ステップごとにおいて、注意する点がいくつかあります。そこで、今回行なうトレーニングでは過去の様々なサンプルに対してのデーターを基に、より良いデーターをとる為の対処法をご提案させて頂ければと思います。
    また、最新のジェネティックアナライザ3500/3500XL情報も合わせて行なわせて頂きます。

PCR Realtime-PCR装置

施設の遠心分離機

  • 超遠心機 ベックマン TL100K
  • optima-TL_01
    設置場所: 203 試料調整室
    仕様: 543,000g、100,000rpm 
    備考: 固定角ローター TLA-100.4(5.1mℓ×8、マイクロチューブ), 近垂直ローター TLN-100(3.9mℓ×8)
    取扱説明書 (学内のみ参照可能です。2.2MB 日本語)

  • 大型高速冷却遠心機 ベックマン HP-25
  • (2台あります)
    HP-25_203_01
    設置場所: 203 試料調整室
    備考: 固定角ローター JLA-10.500(500、250、50、15mℓチューブ使用可能) Max. 10,000rpm

    設置場所: 301 共同利用実験室
    備考:固定角ローター JA-25.50(50mℓ×8),固定角ローター JA25.15(25mℓ×24) Max. 20,000rpm
    取扱説明書 (学内のみ参照可能です。2.8MB 日本語)

  • 冷却遠心機 ベックマン GS-15R
  • GS-15R_01
    設置場所: 301 共同利用実験室
    備考:固定角ローター Max. 14,000rpm
    取扱説明書 (学内のみ参照可能です。1.7MB 日本語)

  • 冷却多本掛遠心機 コクサン HF700R
  • H-700FR_01
    設置場所:203 試料調整室
    備考:スイングローター(コニカル50mℓ×20、コニカル15mℓ×48、マイクロプレート)
    取扱説明書(学内のみ参照可能です。2.8MB 日本語)

  • 冷却多本掛遠心機 クボタ 8920
  • 8920_01
    設置場所: 301 共同利用実験室
    備考:スイングローター(コニカル50mℓ×24、コニカル15mℓ×40、マイクロプレート×8)
    マイクロプレートでエタ沈可能です。
    取扱説明書(学内のみ参照可能です。3.3MB 日本語)

  • マイクロプレート用遠心機 コクサン H26F
  • H26F_01
    設置場所:406 機器分析室
    備考: 冷却機能無し

  • 微量冷却遠心機 コクサン HF-1500DR
  • H-1500DR_301_01
    設置場所: 205学生実験室(2台), 301共同利用実験室(4台), 303 RNA実験室
    備考: Max. 15,000rpm  24サンプル
    取扱説明書 (学内のみ参照可能です。4.2MB 日本語)