Category: お知らせ

Thermo Fisher Cloudの使い方 - デモデータの取得 –

Thermo Fisher Cloudの使い方について、マニュアルを公開します。なお、このマニュアルの公開については、Thermo Fisher SCIENTIFIC株式会社の許可を得ております。 ● Thermo Fisher Cloudに使用できるデモデータの取得 ・Thermo Fisher Cloud v2でTutorialsからデモプロジェクトを作成すると、Fileにデモデータを追加することができます。 ・デモデータは、DNAシークエンスで使用するab1ファイル以外にも、変異解析、次世代シークエンス、リアルタイムPCR等も含みます。   デモデータ取得の方法 ・ホーム画面を開きます。 ・Tutorialsから”Create a Demo Project”をクリックします。     ・下のようなメッセージが表示されます。     ・Projectを開くと、Personal Filesフォルダにデモデータが追加されます。 *追加に少し時間がかかります。       不明な点などありましたら、施設へお問い合わせ下さい。

Thermo Fisher Cloudの使い方 - 再解析 –

Thermo Fisher Cloudの使い方について、マニュアルを公開します。なお、このマニュアルの公開については、Thermo Fisher SCIENTIFIC株式会社の許可を得ております。 ● Thermo Fisher Cloudによる再解析 ・Thermo Fisher Cloudのバージョンアップ(v2)に伴い、サンプルファイルの再解析が可能になりました。 ・簡単に言うと、Quality Checkモジュールがウェブ版Sequence Scannerから、ウェブ版の簡易Sequencing Analysisへとパワーアップしました。 ・以前は再解析を行う場合、施設にあるシーケンサー付属のPC(Sequencing Analysis)で行う必要がありました。 *現在、解析用PCを機器分析室(406号室)に配備しています(より詳細な解析が可能)。興味のある方は施設までお問い合わせ下さい。 ・再解析を必要とする場面は、以下のようなケースです。  ① 蛍光由来の強いピーク(未反応の蛍光物質等)があり、かつ全体的にシグナルが低い場合  ② 最初に短い断片(プライマーダイマー等)がある場合     ・このような場合、解析ソフトが自動で解析できず、灰色で表示された塩基が続くような症状を示します。       再解析の方法 ・サンプルファイルを開きます。 ・再解析したいサンプルファイルにチェックを入れ、右上にある”ATGC”をクリックします。     ・Edit Basecalling Settingsの”Ending base and Calling Ns”において、通常はAt PCR stopにチェックが入っていますが、これを”After XXXbase”と変更します。 *XXXの数値は変更可能です(デフォルトは800base)。       再解析したデータの比較 ・再解析前のデータです。     ・再解析後のデータです。       不明な点などありましたら、施設へお問い合わせ下さい。

登録申請フォームの利用方法

遺伝子実験部門の利用には、利用者登録が必要です。 詳細は、「遺伝子実験部門利用登録について」を参照下さい。   ● 登録申請フォームの利用方法 概要 登録申請フォームへはホームページの上にあるメニュー “利用者登録について” から入ることができます。 *本システムには学内からのみアクセス可能   1. 必要な情報を入力します。  (以降の図はその他(学生・研究者等)の場合) ・“教職員用”と”その他(学生・研究者等)”で登録申請フォームが異なるのでご注意下さい。 ・教職員の方でも予算管理者でない場合(他の人の予算で利用するなど)は、その他(学生・研究者等)から申請して下さい。     2. 登録内容を確認し、問題なければ次に進みます。     3. PDFファイルを再度確認した後、間違いがなければ登録内容を送信します。     4. 送信後に登録内容がメールで届きますので、必ず内容を確認してください。学生や研究員の登録完了メールは、研究代表者にも送信されますのでご確認ください。   ● 2024年度から申請書の印刷および提出は不要となりました。お間違えのないよう、ご注意ください。   ● 登録完了後に登録を取りやめたい場合は、施設までご連絡ください。 不明な点などありましたら、施設までお問い合わせください。