Category: DNAシークエンス

Mac向けSequence Scanner 導入マニュアル_kagoshima-u ver.

Sequence ScannerはDNAシークエンスの波形を確認する際に、非常に使い勝手の良い無料ツールですが、Windows用のソフトであるためこれまでMacユーザーは使用できませんでした。今回、MacにおいてSequence Scannerを導入する方法を確立しましたので、Macユーザーの方は是非試してみて下さい。 *公開につきましては、lifetechnologies社の許可を得ております。 【Applied Biosystems™ Sequence Scanner Software v2.0】 Sequence Scanner Softwareは、Applied Biosystems™ジェネティックアナライザで生成され、Sequencing Analysis Softwareで解析されたデータを表示、編集、印刷、およびエクスポートするがことができます。  Sequence Scannerは下記のページから入手して下さい。  *旧バージョンが必要な場合は施設までお問い合わせ下さい。   サンガーシーケンシングおよびフラグメント解析ソフトウェア   (ThermoFisher SCIENTIFIC)   ● 1. 「Wine」というソフトウェアをインストールします。   *インストール方法は以下のページを参照下さい。     Wine3を利用してmacOSでWindowsアプリを動かそう   *インストールの種類で、必ず「64bit support(optional)」に✓を入れて下さい。 ● 2. サイドバーに自身のPC名が表示されていない場合は、Finderの環境設定から表示するようにします。 ● 3. 隠しフォルダを表示させるため、以下の操作を行います。   *Sequence Scannerは「.wine」という隠しフォルダ内にインストールされます。  ① ターミナルを起動し、以下のコマンドを実行します。    defaults write com.apple.finder AppleShowAllFiles TRUE  ② 設定を適用させる為に、以下のコマンドでFinderを一度終了します。    killall Finder ● 4. ダウンロードしたSequence Scannerをインストールします。   *ダブルクリックするとデフォルトでwineが選択されます。 [Continue]

DNA解析スキルアップトレーニング用テキスト 2016

2016年6月28日および30日に開催しましたDNA解析スキルアップトレーニングについては、テキスト配布に換えて使用したプレゼンテーションファイルを公開します(学内のみ)。 以下のリンクより参照して下さい。 DNAシークエンス スキルアップトレーニング(技術専門職員 西谷篤)   セミナーの内容も含め、DNAシークエンス解析に関する相談はいつでも受け付けています。気軽に声をかけて下さい。

Thermo Fisher Cloudの使い方 - デモデータの取得 –

Thermo Fisher Cloudの使い方について、マニュアルを公開します。なお、このマニュアルの公開については、Thermo Fisher SCIENTIFIC株式会社の許可を得ております。 ● Thermo Fisher Cloudに使用できるデモデータの取得 ・Thermo Fisher Cloud v2でTutorialsからデモプロジェクトを作成すると、Fileにデモデータを追加することができます。 ・デモデータは、DNAシークエンスで使用するab1ファイル以外にも、変異解析、次世代シークエンス、リアルタイムPCR等も含みます。   デモデータ取得の方法 ・ホーム画面を開きます。 ・Tutorialsから”Create a Demo Project”をクリックします。     ・下のようなメッセージが表示されます。     ・Projectを開くと、Personal Filesフォルダにデモデータが追加されます。 *追加に少し時間がかかります。       不明な点などありましたら、施設へお問い合わせ下さい。