– DNAシーケンス受託解析 利用料金 – 利用料金については「こちら」をご参照ください。 ご不明な点がありましたら、管理室(内線：3581)までお問い合わせになるか、「問い合わせフォーム」からお問い合わせください。 – 申請手順 – 「DNAシーケンス受託解析 申請フォーム」から申請する。 ＊メールアドレスの間違いに注意してください。 申請内容がメールで届きますので、必ず内容を確認してください。 – 提出方法 – テンプレートDNA + プライマー(6.4pmol/1種類) = 14μlとなるように 8連tubeに分注する。 ＊提出した混合物の半量(7µl)をサイクルシーケンス反応に使用(10µl反応系) こちらの「テンプレートDNA自動計算シート」を使用すると、テンプレートDNAのサイズや種類を選択すると必要量が自動で計算できます。 ▶ “ダウンロード” テンプレートDNAについては以下の注意事項を参照する。 【テンプレートDNAの品質】 ・PCR産物は、アガロースゲル電気泳動によりサンプル濃度、シングルバンドであることを必ず確認する。 ・PCR産物は未反応のプライマーやdNTP等除去のため、必ず精製を行う。 ・容量の調整には、滅菌水を使用する。 【テンプレートDNAの使用量】 多すぎる場合：読み始めのシグナルが強く、解読距離が短くなる。 波形ピークが検出限界を振り切り、正確に塩基を読み取れない。 少なすぎる場合：シグナルが弱く、信頼性が低いデータになる。 ◇ 提出するTemplateおよびPrimer量の目安(14µl中)
Category: DNAシークエンス
Mac向けPeak Scanner 導入マニュアル_kagoshima-u ver.
Peak Scannerはフラグメント解析の波形を確認する際に、非常に使い勝手の良い無料ツールですが、Windows用のソフトであるためこれまでMacユーザーは使用できませんでした。今回、MacにおいてPeak Scannerを導入する方法を確立しましたので、Macユーザーの方は是非試してみて下さい。 ＊公開につきましては、lifetechnologies社の許可を得ております。 【Applied Biosystems™ Peak Scanner™ Software】 Peak Scanner SoftwareはDNAサイジングソフトウェアで、このソフトウェアを用いてDNAフラグメント解析を行います。サイズに応じてDNAフラグメントを分離し、そのプロファイルを表示し、フラグメントのサイズを正確に計算します。このソフトウェアにより、Applied Biosystemsジェネティックアナライザを用いて生成されたフラグメント解析データを表示、編集、分析、印刷およびエクスポートできます。 Peak Scannerは下記のページから入手して下さい。 ＊旧バージョンが必要な場合は施設までお問い合わせ下さい。 サンガーシーケンシングおよびフラグメント解析ソフトウェア (ThermoFisher SCIENTIFIC) ● 1. 「Wine」というソフトウェアをインストールします。 ＊インストール方法は以下のページを参照下さい。 Wine3を利用してmacOSでWindowsアプリを動かそう ＊インストールの種類で、必ず「64bit support(optional)」に✓を入れて下さい。 ● 2. サイドバーに自身のPC名が表示されていない場合は、Finderの環境設定から表示するようにします。 ● 3. 隠しフォルダを表示させるため、以下の操作を行います。 ＊Sequence Scannerは「.wine」という隠しフォルダ内にインストールされます。 ① ターミナルを起動し、以下のコマンドを実行します。 defaults write com.apple.finder AppleShowAllFiles TRUE ② 設定を適用させる為に、以下のコマンドでFinderを一度終了します。 killall Finder ● 4. ダウンロードしたPeak Scannerをインストールします。 ＊ダブルクリックするとデフォルトでwineが選択されます。 ＊指示に従ってインストールを終了します(特に設定は変更しません)。 ● 5. [Continue]
Mac向けSequence Scanner 導入マニュアル_kagoshima-u ver.
Sequence ScannerはDNAシークエンスの波形を確認する際に、非常に使い勝手の良い無料ツールですが、Windows用のソフトであるためこれまでMacユーザーは使用できませんでした。今回、MacにおいてSequence Scannerを導入する方法を確立しましたので、Macユーザーの方は是非試してみて下さい。 ＊公開につきましては、lifetechnologies社の許可を得ております。 【Applied Biosystems™ Sequence Scanner Software v2.0】 Sequence Scanner Softwareは、Applied Biosystems™ジェネティックアナライザで生成され、Sequencing Analysis Softwareで解析されたデータを表示、編集、印刷、およびエクスポートするがことができます。 Sequence Scannerは下記のページから入手して下さい。 ＊旧バージョンが必要な場合は施設までお問い合わせ下さい。 サンガーシーケンシングおよびフラグメント解析ソフトウェア (ThermoFisher SCIENTIFIC) ● 1. 「Wine」というソフトウェアをインストールします。 ＊インストール方法は以下のページを参照下さい。 Wine3を利用してmacOSでWindowsアプリを動かそう ＊インストールの種類で、必ず「64bit support(optional)」に✓を入れて下さい。 ● 2. サイドバーに自身のPC名が表示されていない場合は、Finderの環境設定から表示するようにします。 ● 3. 隠しフォルダを表示させるため、以下の操作を行います。 ＊Sequence Scannerは「.wine」という隠しフォルダ内にインストールされます。 ① ターミナルを起動し、以下のコマンドを実行します。 defaults write com.apple.finder AppleShowAllFiles TRUE ② 設定を適用させる為に、以下のコマンドでFinderを一度終了します。 killall Finder ● 4. ダウンロードしたSequence Scannerをインストールします。 ＊ダブルクリックするとデフォルトでwineが選択されます。 [Continue]