現在、施設ではDNAシーケンスの泳動において、700bp未満の場合は”Fastモジュール”を、700bp以上の場合は”Standardモジュール”を使用していますが、通常はFastモジュールを優先して泳動しています。 施設で検討した結果、Fastモジュールでも約800bpは問題なく読めることが判りましたので、今後はDNAシーケンスの泳動条件を「800bp未満と800bp以上」に変更します。 　＊2021年10月20日から変更 モジュール名 配列の長さ 泳動時間 Fast 約800bp 約1時間 通常はこちらを優先　／　短い配列を読むとき、お急ぎのときはこちらを推奨 Standard 約900bp 約2時間 なるべく長く読みたいときはこちらを推奨　／　解析結果の返送が遅くなる場合が有り 　 施設では、月に一回、既成品(Sequencing Standard)を用いてDNAシーケンサーのチェックをFastモジュールで行っていますが、800bp以上問題なく読めています。 ＊データもありますので、お時間があればご確認下さい。 　▶　【 Fastモジュール-DATA 】 学内限定 　▶　【 Standardモジュール-DATA 】 学内限定 ● Performance Check(Fastモジュール使用) ● Performance Check(Standardモジュール使用)

Sequence ScannerはDNAシークエンスの波形を確認する際に、非常に使い勝手の良い無料ツールですが、Windows用のソフトであるためこれまでMacユーザーは使用できませんでした。 前回、MacにおいてWineを利用してSequence Scannerを導入する方法を紹介しましたが、MacOSのバージョンアップ(Catalina等)により使用できない状態となっていました。今回、PlayOnMacアプリケーションを使用してSequence Scannerを導入することに成功しましたので、ご報告します。 ＊公開につきましては、lifetechnologies社の許可を得ております。 【Applied Biosystems™ Sequence Scanner Software】 Sequence Scanner Softwareは、Applied Biosystems™ジェネティックアナライザで生成され、Sequencing Analysis Softwareで解析されたデータを表示、編集、印刷、およびエクスポートするがことができます。 　Sequence Scannerは下記のページから入手して下さい。 　　サンガーシーケンシングおよびフラグメント解析ソフトウェア 　　(ThermoFisher SCIENTIFIC) 　Sequence Scanner2(Windows7)　 ＊学内限定でダウンロード可 　Sequence Scanner(WindowsXP)　 ＊学内限定でダウンロード可 　 　 ・以下の手順は2台のMacを使用して実際にインストールした手順になりますが、PCの環境により諸々の動作が異なっていましたので、ケースバイケースで対応して下さい。 ・インストールは管理者権限のアカウントで行って下さい。 ● 1. macOS用パッケージマネージャーであるHomebrewをインストールします。 ① 以下のページに移動します。 　　Homebrew ② HPの中に記載されている以下のスクリプトをコピーします。 　＊”/bin/bash”の前に半角スペースが必要。 /bin/bash -c “$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install.sh)” ③ ターミナルを開き、上記のスクリプトをペーストして実行します。 ● 2. Homebrewを使用し「xquartz」をインストールします。 ・ターミナルで以下を入力します。 brew cask install [Continue]