現在、施設ではDNAシーケンスの泳動において、700bp未満の場合は”Fastモジュール”を、700bp以上の場合は”Standardモジュール”を使用していますが、通常はFastモジュールを優先して泳動しています。
施設で検討した結果、Fastモジュールでも約800bpは問題なく読めることが判りましたので、今後はDNAシーケンスの泳動条件を「800bp未満と800bp以上」に変更します。
*2021年10月20日から変更
モジュール名 | 配列の長さ | 泳動時間 |
---|---|---|
Fast | 約800bp | 約1時間 |
通常はこちらを優先 / 短い配列を読むとき、お急ぎのときはこちらを推奨 | ||
Standard | 約900bp | 約2時間 |
なるべく長く読みたいときはこちらを推奨 / 解析結果の返送が遅くなる場合が有り |
施設では、月に一回、既成品(Sequencing Standard)を用いてDNAシーケンサーのチェックをFastモジュールで行っていますが、800bp以上問題なく読めています。
*データもありますので、お時間があればご確認下さい。
▶ 【 Fastモジュール-DATA 】 学内限定
▶ 【 Standardモジュール-DATA 】 学内限定
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