Category: DNAシークエンス

技術講習会(次世代シーケンスデータ解析)

メイズ社 次世代シークエンスのデータ解析に関するセミナーの開催についてお知らせします。 日時:2013年12月12日(木曜) 13時00分~14時30分 内容:次世代シークエンサのデータ解析の課題と解決方法 副題:〜コンピュータの専門家を必要としないWeb解析システム〜 場所:遺伝子実験施設 セミナー室(1F) 担当:メイズ株式会社 湯野川春信 概要  ここ最近、次世代シーケンサの導入が加速的に進み、研究成果につながる例も多くみられるようになってきました。しかし、その一方で、データ解析に関する課題のいくつかが解決されず、研究そのものが先に進まないケースも多々あるようです。  次世代シーケンサのデータ解析を行う場合の課題のひとつは、データ解析のソフトウエアを操作するコンピュータの専門家をどう確保するかです。次世代シーケンサの導入速度とデータ産出量は、データ解析ができる人材を育成するスピードに比べるとはるかに膨大なものです。  そこで、弊社では、ウエットのテクニシャンが次世代シーケンサの操作の延長でシームレスにWebインタフェースで利用できる自動解析システムを開発して提供しています。  また、もうひとつの課題はデータ解析の過程で発生する様々の問題・課題の対応です。我々は、コンサルティング(オプション)を含むサポート体制をご用意し次世代シーケンサによるデータ解析のトータルソリューションを提供いたします。  本セミナーでは、次世代シーケンサのデータ解析の課題や必要なスキルを分析し、それを解決するための弊社独自の製品をご紹介いたします。 ● データ解析の課題と必要なスキル データ解析を行う人材には、いくつかの異なるスキルが必要です。それらのスキルを分析し、また、課題を明確にして、その解決方法をご提案いたします。 ● デコンピュータの専門家を必要としないWeb解析システムのご紹介 データ解析の課題のひとつの解決方法として、コンピュータの専門家を必要としないWeb解析システムをご紹介します。弊社でご提供できるアプリケーションのリストをご紹介し、特に、リッチアノテーションシステム、De novo mRNA-seq、r16sの菌叢解析などを具体例としてご紹介いたします。

技術講習会(次世代シークエンサー 第3回)

イルミナ社製 次世代シークエンサー(MiSeq System)に関するセミナーの開催についてお知らせします。 日時:2013年7月4日(木) 13:30~15:00 場所:遺伝子実験施設(セミナー室) 担当:未定 内容:デスクトップ型次世代シーケンサー MiSeqのご提案 概要 MiSeqシステムは幅広いシーケンスアプリケーションを可能にしたパーソナル型次世代シーケンサーです。 PCR産物(アンプリコン)シーケンス、バクテリア等の地位差がゲノムシーケンスなど、キャピラリーシーケンサーで行ってきた研究は、MiSeqシステムを用いることで、より低コストに、かつ迅速に高精度の結果を得ることができます。 また次世代シーケンサーの利点を活かしたターゲットリシーケンス、ChIP-Seq、Small RNAシーケンスも可能となります。 本セミナーでは実際の応用事例を中心に、1ラン8-15万円、約1日で最大80億塩基の産出を可能にした、パーソナル型次世代シーケンサーMiSeqシステムをご紹介させて頂きます。 機器の仕様等、詳細につきましては下記のリンクをご参照下さい。 MiSeq

技術講習会(次世代シークエンサー 第2回)

lifetechnologies社製 次世代シークエンサー(Ion torrent)に関するセミナーの開催についてお知らせします。 日時:2013年6月27日(木) 13:30~15:00 場所:遺伝子実験施設(セミナー室) 担当:未定 内容:次世代シーケンサ 新時代   :-1,000ドルゲノムの時代へ- 概要 ベンチトップ次世代シーケンサの登場により遺伝子解析コスト・時間はここ数年で大幅に減少しており、それに呼応するように利用者のすそ野が広がりつつあります。 ライフテクノロジーズが提案するデスクトップタイプの次世代シーケンサ、Ion torrentシーケンサは、DNA伸長反応時に放出される水素イオンを半導体センサーで検出し塩基を解読していくという、革新的かつシンプルなケミストリがベースとなっています。 そのため、蛍光標識、光学系、スキャニングを必要とせず、これまでの手法では想像もできなかったスピードとコストで解析することを実現しました。 この技術は尚も進化を続けており、更なるリード長の伸長、スループットの向上、あらたなアプリケーション提案など、次々と研究者のニーズに応えていきます。 わずか10ngのDNAから目的のターゲット領域を網羅的に解析する手法など、従来のキャピラリシーケンサでは想像することもできなかった実験が、はるかに低コストかつ簡便に行えるようになるということを誰が予想しえたでしょうか。 よりシンプル、よりスピーディー、より低コストに。Ion torrent シーケンサの概要と活用事例を紹介させて頂きます。 機器の仕様等、詳細につきましては下記のリンクをご参照下さい。 Ion torrent