Month: March 1970

2024年度 利用者登録募集について

2024年度の利用者登録申請を行います。  現在、登録申請を停止しています   - 利用者登録の流れ – 日程 新規登録の場合 継続登録の場合 3/5(火)〜3/22(金) Web登録 Web登録 4/5(金)〜4/26(金) オンライン講習の受講 不要 オンライン講習の小テスト回答 4/9(火)〜 IDカード登録 不要  ★ 2024年度から申請書の印刷および提出は不要となりました。  ☆ Web登録後に登録内容がメールで届きますので、必ず内容を確認してください。    申請方法  ・Webページから申請をしてください。継続の方も毎年度申請が必要です。  ・方法は下記のURLに詳しい説明がありますので、ご覧ください。   ▶  「遺伝子実験部門 利用者登録について」  締切  ★ 2024年3月22日(金)  ※ 締切日を厳守してください。  ・締切日以降、事務手続きの都合上、登録申請は中止します。  ・登録申請の再開は[genet]でお知らせします。  オンライン講習について  4/5(金)〜4/26(金)  ・新規登録者はmanabaによるオンライン講習の受講が必要です。  ・継続登録者のオンライン講習会の受講は不要です。    *オンライン講習と小テストは4月初旬にメーリングリストで案内します。    *manabaの登録ができない方は、管理室までご連絡ください。  ・受講後に入館用のIDカード登録を行います。  IDカード登録について  4/9(火)〜 随時受付  ・IDカードの登録は施設のセミナー室で行います。  ・IDカード登録の受付時間は平日の10時から12時、13時から16時になります。    

autoflex speed_Mascot Database

【biotools】 -software- Mascotによるデータベース検索を支援し、さらに検索によってヒットしたタンパク質あるいは既知タンパク質のアミノ酸一次配列情報をスペクトルにマッチング表示する。 またリン酸化などの翻訳後修飾の有無に関しても容易なデータ表記が可能。 一方、検索で有意なヒットが得られなかった未知ペプチドに関しては、RapiDeNovoによるDeNovoシークエンシングが可能。 Mascot Server Databases info 2020.03.13 引用: どのデータベースを使うか ~データベース検索と配列解析・誤解と難題~ 冗長性(Redundancy)とは、一般的に、必要最低限に加えて余分や重複がある状態またはその余剰の多さを指す。情報科学の分野では、データの記録や伝送において必要最低限以外に使われている無駄(冗長)なデータの量を示す。 例えば、SwissProtでPMFを検索するときは冗長性が低いので1つに決まるが、同じデータをNCBIで検索すると、PMFの場合は質量そのものがペプチドの質量となるので、色々な候補がマッチングしてくるようになり、どれが本当のペプチドにマッチしているのかわからない。最近の傾向としては、PMFを使ってタンパク質を同定したという論文では、MSMSのデータを使って同定をすることが中心となっている。PMFは企業での品質管理や、研究でのタンパク質の定性(確かにあるか確認する)などに使用されている。 DB Name Category File Size Target Environmental_EST 環境 58.99Mb Nucleic acid(DNA) Fungi_EST 菌類 2.3Gb Nucleic acid(DNA) Human_EST ヒト 5.2Gb Nucleic acid(DNA) Invertebrates_EST 無脊椎動物 11.5Gb Nucleic acid(DNA) Mammals_EST 哺乳類 3.5Gb Nucleic acid(DNA) Mus_EST マウス 2.8Gb Nucleic acid(DNA) Plants_EST 植物 17.3Gb Nucleic acid(DNA) [Continue]