Category: 機器取扱い

Thermo Fisher Cloudの使い方 - データ閲覧 –

Thermo Fisher Cloudの使い方について、マニュアルを公開します。なお、このマニュアルの公開については、Thermo Fisher SCIENTIFIC株式会社の許可を得ております。 ●Thermo Fisher Cloudとは ・DNAシークエンス解析の結果を確認するために、施設ではlifetechnologies社のSequence Scannerを推奨して来ました。理由として、配列を確認するだけであれば他社のフリーソフトでも可能ですが、ab1ファイルから得られるRaw Data等の情報を確認できるソフトはSequence Scannerに限られていたためです。情報の中でも特にRaw Dataを解析すると、うまくいかなかったサンプルに関するヒントを読み解くことができます(施設主催のDNAスキルアップトレーニングで解説)。 ・しかしながら、Sequence Scannerは非常に使いやすいソフトであるのですが、動作環境がWindowsに限定されており、MacなどでRaw Dataを確認するためには、Virtual PC等でWindowsを起動する必要がありました。また、Windows7までしか動作しませんので、Windowsのバージョン更新に伴い、徐々に使用できないユーザーが増えて来ました。 ・Thermo Fisher Cloudとは、Thermo Fisher社が提供する無償のクラウド環境で(10GBまで)、DNAシーケンス、次世代シークエンス、リアルタイムPCRなどの2次解析ソフトウェアが利用できます。クラウド環境であるため、PC機種、環境に環境なくアクセスでき、Windows 10やMacなどでもRaw Dataを確認することができます。 ・さらに、Variant Analysisによる変異解析、Next-generation Confirmationによる次世代シークエンサーとのデータ比較なども可能です。   アカウント登録およびサインイン ・Thermo Fisher Cloudのホームページにアクセスします。    https://www.thermofisher.com/jp/ja/home/cloud.html ・”サインイン”をクリックします。     ・”Create an account”から新しいアカウントを作成します。(初回のみ)     ・Account作成ページで必要項目を入力します。 ・入力後、登録したメールアドレスにVerificationのリンクが送られるので有効化します。 *注意 有効化がされていないと、サインインすることができません。メールが届かない場合は、迷惑メールに入っていないか確認して下さい。     ・ユーザー名とパスワードを入力し、サインインします。       メイン画面の操作 ・Thermo Fisher Cloudのメイン画面は以下のようになります。     ・”Quality Check”のアイコンをクリックします。 ・”Creative New Project”を選択し、Type [Continue]

機器予約システムの利用法

機器予約システムの利用は専用アカウントが必要です。 [2018年度からの変更] ・申請書の提出は不要となりました。 ・学生は研究代表者(教員)のアカウントを使用します。 ・研究代表者のアカウントについては施設までお問い合わせ下さい。     【予約システム概要】 予約システムへは遺伝子実験施設のウェブサイトのメニューから入れます。 *本システムには学内からのみアクセスできます。 *対象機器は「機器の利用方法について」をご参照下さい。 ・予約システムの画面では現在の予約状況を確認することができます。 ・新規に予約を行う場合、既に成立している予約の取り消しや変更はログインしてから行います。 ・発行されたアカウントとパスワードを入力してログインします。 ・ログイン後、再びカレンダー画面へ戻り、希望日を選択し予約編集画面に入ります。 ・必要事項を入力して保存します。 ・連絡先等には学科、研究室名、研究代表者(指導教員など予算管理者)、電話番号(学内線あるいは携帯電話番号など確実に連絡ができる番号)を入力します。 ・同じ内容の予約を繰り返し行う場合には、繰り返しの様式を利用できますが、むやみに予約を取ることは止めて下さい。 ・予約が成立すると確認のe-mailが送られてきます。 ・予約の確認はカレンダー画面から該当の予約をクリックして閲覧できます。 ・自分が入れた予約の変更や取り消しもこの画面から可能です。変更や取り消しを行った場合にも新規予約と同様にe-mailが届きます。 ・パスワードは各自で変更できます(画面右上のユーザーリストからアカウント編集画面に入れます)。 不明な点などありましたら、施設へお問い合わせ下さい。

機器予約

以下の対象機器については、予約システムで予約後に利用して下さい。 予約システムの利用に関する注意事項 項 内容 備考 1 アカウント 予約システムのアカウントは研究室単位 全ての機器に共通です 2 登録不要 予め研究代表者に対してアカウントを発行しています 3 申請不要 申請書等は不要です 4 操作方法 “こちら” をご参照下さい 5 予約 1 予約システム対象機器は必ず予約をしてから使用します 6 予約 2 予約システムに登録した時間は他の方が使用できません 相互に思いやりを持って利用して下さい 7 予約 3 予約は実験に合わせて無理のない時間を登録して下さい 8 予約 4 予定がなくなった場合や実験が早く終了した場合は、 速やかに変更またはキャンセルを行います 下記リストに含まれない機器については、これまで同様の利用方法となります。今後さらに予約システムの対象とした場合には、その都度お知らせします。 ◎ 機器に利用に関して  2016年4月 改定 ・微生物培養室(402号室)の機器は実験室の利用申請がない場合、使用できません。  *微生物培養室は占有利用。     予約システム対象機器 No. 分類 機器名 部屋 1 サーマルサイクラー Veriti Pro 共同利用実験室 3F [Continue]