DNA塩基配列解析結果のデータに関して

  • ごく稀にですが、塩基配列解析結果を送付した後に、利用者から「seqファイルが見当たらないので再度送付して下さい」との問い合わせがあります。通常,送られた結果の中にseqファイルが無い場合は、解析結果が思わしくなく、配列として扱うことができなかった場合が殆どです。その場合は適当な解析ソフトウェアによってクロマト(波形)のファイルを表示することによって原因を明らかにする一助となるかと思われます。
  • 遺伝子実験施設のHPの右側にあるArchivesより、DNAシーケンスを選び、その中に「DNAシーケンス波形データ編集ソフトウェアについて」というページがあります。MAC、WINDOWSに対応したソフトウェアがありますのでご自身のパソコンにあったものをご使用下さい。
  • WINDOWSであればApplied Biosystems純正のSequence Scanner Software ver1.0が使いやすいと思われます。
    このソフトウェアを使用すればab1ファイルより波形データを参照することができます。
  • クロマトデータをご覧になってご不明な点がありましたらお気軽にご質問下さい。

技術講習会 PCR サーマルサイクラー

アプライドバイオシステムのPCR機 Veriti のデモを当施設の3階廊下にて実施しています。このPCR機のセミナー形式の技術講習会を開催しますのでご参加ください。

  • 日時:平成20年6月19日(木曜日)
  • 午前の部10時30分〜  
    午後の部14時30分〜
    (各30分間ぐらいです)

  • 場所:遺伝子実験施設 セミナー室
  • 内容:高速タイプのサーマルサイクラーの紹介
  1. Fast PCRとして25〜35分でPCRが完了(Fastでありながら、通常のPCRと同等またはそれ以上の結果が得られる)
  2. 簡単なセットアップと使いやすさを紹介
  3. ポータビリティが可能なUSBポートを装備(USBメモリを使用できる)
  4. 今までのグラジエント機能以上の精度と正確性を持ったブロックの紹介
  5. 既存の9700サーマルサイクラーの実験系をそのまま再現できる
  6. 複数のサーマルサイクラーをPCから遠隔管理できる

第22回遺伝子実験施設セミナー開催のお知らせ

遺伝子実験セミナーを下記の通り開催いたします。
多数のご参加をお待ちしております。

  • 演  題:光回復酵素遺伝子を利用したUVB耐性イネ品種の作出と紫外線環境影響評価
  • 講  師:日出間 純 先生 (東北大学大学院 生命科学研究科 准教授)
  • 日  時:6月25日(水曜日) 16時から
  • 場  所:遺伝子実験施設 セミナー室

講演要旨は(genet:00658)添付ファイルに記載しております。ご覧ください。